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1000美元就可以完成全基因组测序?
2019-07-19 05:41:19

基因测序,硝烟再起。总部位于加利福尼亚州卡尔斯巴德的Life Technologies公司宣布,今年将在第一代测序仪Personal Genome Machine的基础上推出一款新的测序机器:Ion Proton。它是由Life Technologies的子公司Ion Torrent研发的,能够在一天内完成全部基因组测序,而且所需花费不到1000美元。

总部位于加利福尼亚州圣迭戈市的Illumina公司作为行业老大,显然也不甘示弱,其宣称将在今年下半年推出自主研发的竞争产品HiSeq 2500。Life Technologies需要客户购买整个新机器, Illumina则不同,只需要客户把先前买的HiSeq 2000升级下就可以了,花费很少。

那么,这场测序仪器上的竞争最终将会鹿死谁手呢?

针对Illumina公司HiSeq的售价高达69万美元,Ion Torrent打出的是低价牌。科学家们认为Ion Proton的新产品能够达到它所宣称的测序速度,因为其现有的产品Personal Genome Machine表现得非常好。由于有了第一代产品作为基础,Ion Torrent相比之下已经领先了一步。其他的一些公司则还在摸索着新技术以求能设计出第一代产品,上周加利福尼亚的Pacific Biosciences of Menlo Park公司炒掉了陷入财务丑闻中CEOs,总部设在马萨诸塞州剑桥市的Helicos公司则在为产品没有销量而挣扎。

SeqAnswers.com论坛预计Ion Proton将于2012中期发布的第一代测序芯片能测量3到6个外显子(基因组中能够编码蛋白质的那部分)。Life Technologies公司自己则宣称今年年底将发布的二代测序芯片Proton II能够完成全部基因组测序。Life Technologies公司期望Ion Proton能在诊断测序市场分得一杯羹,因此他们计划于年底向美国食品和药物管理局提出申请,以求能把Ion Proton列入医疗器械名单。诊断性测序市场规模虽小,但发展迅速,目前被Illumina公司垄断着。

但是科学家们不太相信,Ion Proton的基因组测序成本会低于1000美元或者说会低于HiSeq。研究人员指出目前使用的Personal Genome Machine完成全基因组测序需要数万美元。Life Technologies公司宣称1000美元已经包括了测序芯片以及测序所需的试剂成本。但高盛的分析师Isaac Ro在一份报告中指出:Proton II的芯片价格就需要1000美元,Life Technologies如何能将成本降到1000美元以下?

但Ro也进一步指出了:“即使考虑到购买者还需要为服务器和自动化样品制备设备额外支付95000美元,Ion Proton仍然算是便宜的,它只需要14万美元。价格优势非常巨大。”

但是Illumina也有它的优势,它只需要将原产品升级到HiSeq 2500,花费只有5万美元。对这些已经购买Illumina产品的人来说,投资一台新的Ion Proton实在没什么诱惑力,一方面Illumina的测序技术非常精确,另一方测序市场也已受到了财政紧缩政策的影响。而在发布Personal Genome Machine短短不到一年时间就推出新的产品,Life Technologies似乎也惹恼了他们的老客户。Nick Loman在博客——病原体:基因和基因组中就问到:“这么早就推出新产品是否真的是一个明智之举?”

但是,不管怎么说,通过研发出Ion Torrent,Life Technologies公司终于找到了一条可以和Illumina公司竞争的途径,这是到目前为止其他公司还没能做到过的。最终获益的当然还是消费者。随着各种测序技术的不断进步,或许我们将迎来新的测序技术辉煌发展的一年。